Ште́фан А́йгнер (нем. Stefan Aigner; род. 20 августа 1987, Мюнхен, Германия) — немецкий футболист, полузащитник клуба «Оттерфинг».

Айгнер начал играть в футбол в 1991 году в родном городе, в футбольной академии клуба «Мюнхен 1860». До 2006 года он прошёл там все возрастные группы. После окончания академии он покинул клуб и перешёл в «Ваккер» из другого баварского города, Бургхаузена.

Там Айгнер в первом же туре сезона провёл свою первую игру на профессиональном уровне. Это была выездная игра «Ваккерa» против «Карлсруэ». Всего в сезоне 2006/07 он вышел на поле 28 раз и забил 5 мячей. Помимо этого он трижды сыграл в Кубке Германии, забив один гол.

После вылета «Ваккерa» из Второй Бундеслиги Айгнер летом 2007 перебрался в Билефельд, в «Арминию». Сначала он играл там за вторую команду. 14 сентября 2008 он дебютировал за «Арминию» в Бундеслиге в игре против «Бохума». До зимнего перерыва его выпускали на замену 5 раз, в сумме это составило всего 33 минуты игрового времени.

В январе 2009 Штефан вернулся в родной город и присоединился ко «львам». В сезоне 2009/10 он стал со своими 8 мячами одним из лучших бомбардиров команды. По окончании сезона он был выбран болельщиками «1860» лучшим игроком.