«Истра» — российский футбольный клуб из одноимённого города в Московской области. В сезонах 2008, 2009, 2010 и 2011/12 выступал на профессиональном уровне во Втором дивизионе, зона «Запад». Обладатель Кубка Московской области 1999 и его финалист в сезоне 2005.
Футбольный клуб «Истра» был основан в 1997 году. Администрацией Истринского района и руководством ОАО ПСО-13, возглавляемым Юрием Воротниным, было принято решение возродить футбольную команду, которая ещё в советские времена участвовала в первенстве среди коллективов КФК. Команду собирали в основном из лучших игроков Истринского района, играющим тренером команды в то время был Владимир Антипов, владельцем клуба стал Юрий Воротнин. В первый же год своего существования команда заняла второе место в турнире.
На следующий год потенциал и результаты команды заметно усилились, и главным образом за счет приглашения на тренерский пост известного в прошлом нападающего московского ЦСКА и алматинского «Кайрата» 70-80 годов Геннадия Штромбергера. После завершения карьеры действующего игрока Штромбергер работал помощником главного тренера в ЦСКА и ЦСКА-2, а также являлся начальником армейской команды. Приняв «Истру», он пригласил в команду нескольких опытных игроков из Москвы. Игра «Истры» под началом опытного специалиста преобразилась, и в первый же сезон клуб выиграл все турниры, в которых участвовал — занял первое место в Чемпионате области и стал обладателем Кубка.
Успех «Истры» в 1998 году позволил ей на следующий сезон стартовать в турнире рангом выше — в Первенстве России среди команд ЛФК. В 1999 году команда заняла 14 место в турнирной таблице и после этого ни разу ниже четвёртого места не опускалась. При этом в команде в разные годы выступало немало ярких футболистов. Это и известный полузащитник «Зенита» Роман Широков, и Алексей Щепинов возглавивший ФК «Фортуна» в 2007 году, а также Алексей Чекалин, Андрей Акименко и Алексей Гончаров, прошедшие школу первого и второго дивизионов чемпионата России. В 2007 году команда заняла первое место в Первенстве России среди ЛФК, сумев выйти во второй дивизион и получив профессиональный статус.
В сезоне 2008 первый клуб провёл первый официальный матч в качестве профессионального клуба, сыграв дома 20 апреля с ФК Волочанин-Ратмир 0:0. В кубке России клуб выбыл в первой же стадии, проиграв дома Зеленограду 1:3. По итогам сезона 2008 клуб занял 15 место из 19 и сохранил прописку во Втором дивизионе.